分子生物学-肽和多肽

2020-04-30 10:15:57 160 收藏
分类专栏： 计算理论与神经科学
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论文研究-面向多肽的分子对接算法性能对比研究.pdf
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蛋白质-多肽间相互作用是计算生物学中的热门方向，对其结合的精确预测对于了解体内复杂的信号通路以及蛋白质功能，及进一步进行药物设计有着至关重要的作用。蛋白质-多肽对接方法能够有效地模拟蛋白质-多肽间相互作用，其对接性能直接决定模拟实验的准确性和成功与否。针对当前主要的蛋白质-多肽对接方法，综合测试了其算法性能；同时将本实验室开发的基于全信息粒子群算法的分子对接工具FIPSDock（Fully-Informed-Particle-Swarm-Dock）延伸到蛋白质-多肽对接领域，并评估其性能。利用标准蛋白质-多肽对接数据集（peptiDB）的21个测试例及13个定制测试例进行性能测试，主要对比分析了各算法的成功率和对接精度。结果表明FIPSDock可用于蛋白质-多肽对接，并相对于其他对接算法展示出优异的性能。
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